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模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;引物設(shè)計(jì)的基本原則引物設(shè)計(jì)軟件無(wú)需繁瑣的...
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順便對(duì)bam文件進(jìn)行簡(jiǎn)單QC,參考直播我的基因組系列。為了提高比對(duì)速度,就需要根據(jù)參考基因組序列,經(jīng)過(guò)BWT算法轉(zhuǎn)換成index,而我們比對(duì)的序列其實(shí)是index的一個(gè)子集。當(dāng)然轉(zhuǎn)錄組比對(duì)還要考慮到可...
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多序列比對(duì)分析軟件目前有很多功能強(qiáng)大的生物學(xué)軟件,具有豐富功能引物設(shè)計(jì),基因序列比對(duì),質(zhì)粒圖譜繪制、甚至實(shí)現(xiàn)了1個(gè)軟件同時(shí)對(duì)DNA、RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行分析的功能。(1)是一款高度集成化的分子生物學(xué)應(yīng)用...
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幾個(gè)常用的多序列比對(duì)軟件是一個(gè)簡(jiǎn)單常用的核酸序列分析軟件,它支持多序列比對(duì)、序列同源性分析、限制性酶切位點(diǎn)分析、PCR引物設(shè)計(jì)、質(zhì)粒繪圖等多種功能,并且是非常友好的界面、軟件占用內(nèi)存小、兼容性也比較好...
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首先要做的就是將測(cè)序得到的reads比對(duì)到人基因組參考序列上。人基因組參考序列的來(lái)源、詳細(xì)信息及下載地址已經(jīng)知道啦,那么我們來(lái)看看利用什么軟件或算法來(lái)將測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到31億堿基序列上呢?大家是否對(duì)于比...
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)軟件不能很好的用于堿基轉(zhuǎn)換的比對(duì)。盡管有一些為堿基轉(zhuǎn)換測(cè)序設(shè)計(jì)的比對(duì)軟件,例如,SLAM-DUNK,但是比對(duì)的結(jié)果總是很不理想。發(fā)布了一個(gè)專門為堿基轉(zhuǎn)換測(cè)序設(shè)計(jì)的比對(duì)軟件:HISAT-3N。支持所有...
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高級(jí)軟件工程師展示了使用應(yīng)用程序運(yùn)行多序列比對(duì)的兩種非??焖俚姆椒āA私馕覀冇糜谛蛄薪M裝和分析的最新應(yīng)用程序。如果使用的是單樣本數(shù)據(jù),則可以快速添加序列并運(yùn)行程序集,而無(wú)需指定程序集參數(shù)。17.2中的...
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”,添加需要比對(duì)的DNA序列。3、找到DNA序列所在文件夾,雙擊需要比對(duì)的序列,然后點(diǎn)擊“Done”5、雙擊出現(xiàn)的比對(duì)結(jié)果,進(jìn)行查看。選擇.Seq格式文測(cè)序結(jié)果文件,僅可以查看序列,看不到測(cè)序峰的情況...
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還可以點(diǎn)擊引物序列鏈接,查看引物序列的詳細(xì)信息。引物查詢:可以根據(jù)引物序列、基因名稱、生物體等信息進(jìn)行引物查詢。提供的工具,設(shè)計(jì)合適的引物。網(wǎng)站的主頁(yè)上,輸入您需要查找的引物序列或信息。設(shè)計(jì)引物網(wǎng)站公...
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