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發(fā)布時(shí)間:2023-08-01
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“-用于分子生物學(xué)研究、蛋白質(zhì)分析、基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的完整序列分析軟件”
旨在為生命科學(xué)家提供創(chuàng)新且易于使用的數(shù)據(jù)分析軟件工具。 無論您的重點(diǎn)是下一代測序組裝和解剖、臨床研究還是傳統(tǒng)序列解剖,總有一個(gè)軟件包可以滿足您的研究需求。
如需了解完整功能請點(diǎn)擊上圖或“”
-分子生物學(xué)研究工作流程
手動(dòng)虛擬克隆
每次使用 Pro,您都可以對實(shí)驗(yàn)室的克隆實(shí)驗(yàn)充滿信心!
從本質(zhì)上講,分子克隆的過程非常簡單,但如果沒有適當(dāng)?shù)囊?guī)劃和考慮,即使是最簡單的克隆實(shí)驗(yàn)也可能很快出錯(cuò)。 Pro 的虛擬克隆可讓您輕松、自信地規(guī)劃克隆實(shí)驗(yàn),以便在實(shí)驗(yàn)室中正確進(jìn)行。 Pro 提供無與倫比的靈活性,可幫助您滿足實(shí)驗(yàn)要求,包括同時(shí)批量克隆片段組的能力,并指導(dǎo)您使用所有最流行的克隆方法逐步制備載體和擴(kuò)增插入片段:,,,,, In- 、TA、TOPO 和 PCR 引導(dǎo)的限制性內(nèi)切酶克隆。 Pro 中的計(jì)算機(jī)克隆為您提供正確的規(guī)劃和計(jì)劃,以便您每次都可以充滿信心地嘗試克??!
4步執(zhí)行虛擬克隆
克隆序列驗(yàn)證
使用 Pro 確認(rèn)您在實(shí)驗(yàn)室中創(chuàng)建的克隆的真實(shí)性
您已在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行克隆并計(jì)劃繼續(xù)下游,但您如何知道所有步驟都產(chǎn)生了預(yù)期的重組克隆? 許多研究人員通過測序驗(yàn)證了克隆的真實(shí)性。 我們可以輕松地執(zhí)行克隆序列驗(yàn)證,以確認(rèn)您的測序結(jié)果與您設(shè)計(jì)的克隆完美匹配。 我們的克隆序列驗(yàn)證工作流程確認(rèn)克隆完全包含正確方向的感興趣的插入片段,與載體處于框內(nèi),并確認(rèn)整個(gè)克隆中有足夠的跟蹤文件覆蓋。 如果在克隆序列驗(yàn)證過程中發(fā)現(xiàn)差異,我們將向您準(zhǔn)確顯示差異所在,以便您解決它們。 使用 Pro 的克隆序列驗(yàn)證工作流程在下游實(shí)驗(yàn)之前捕獲讀取錯(cuò)位和插入錯(cuò)誤。
克隆序列驗(yàn)證的 4 個(gè)步驟
凝膠電泳模擬
通過 Pro 中的凝膠電泳模擬跳過試驗(yàn)和錯(cuò)誤并確認(rèn)您的理想條件!
凝膠電泳有時(shí)需要大量的規(guī)劃工作和反復(fù)試驗(yàn)才能確定完美的瓊脂糖比例和分子量標(biāo)記集來解析 DNA 片段。 其他時(shí)候,限制性摘要形成如此復(fù)雜的限制性模式,以至于很難確定限制性摘要是否完整。 這就是我們在 Pro 中提供虛擬凝膠電泳的原因,它允許您對一個(gè)或多個(gè) DNA 片段應(yīng)用不同的限制性內(nèi)切酶并模擬消化以確定電泳凝膠上產(chǎn)物的預(yù)期大小。 使用凝膠電泳模擬輕松確定理想的瓊脂糖比例和一組分子量標(biāo)記,以便在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行凝膠電泳之前解析 DNA 片段。 在實(shí)驗(yàn)室中運(yùn)行實(shí)際凝膠后,您可以將凝膠或其圖像與虛擬凝膠電泳圖像并排,以識(shí)別具有復(fù)雜條帶圖案的凝膠。 通過 Pro 中的凝膠電泳模擬跳過試驗(yàn)和錯(cuò)誤并確認(rèn)您的理想條件!
4步進(jìn)行虛擬凝膠電泳
多序列比對
使用 Pro 進(jìn)行精確的序列比對和深入分析
眾所周知,有許多多重序列比對工具,但初始序列比對只能讓您到目前為止。 真正讓您走上回答研究問題的道路是對齊后分析。 Pro 為您提供多序列比對每個(gè)階段所需的一切,除了比對基因級(jí)和基因組規(guī)模序列數(shù)據(jù)所需的算法之外,還能夠在比對后階段進(jìn)行更深入的挖掘。
Pro 指導(dǎo)您完成比對后過程,包括使用 RAxML 生成和比較多個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹以獲得最大殘差樹,或使用鄰居連接方法。 您可以輕松隔離新子比對的感興趣區(qū)域,編輯和修剪單個(gè)序列或整個(gè)比對,并在生成適合發(fā)布的高質(zhì)量圖像之前自定義比對的外觀。
多序列比對4步
成對序列比對
使用 Pro 輕松執(zhí)行多重和成對序列比對
有時(shí),直接從多序列比對中檢測一對序列可能會(huì)讓您更好地了解該對的相關(guān)性。 眾所周知,有時(shí)配對序列比比較性多重比對更合適,例如,將未表征基因的序列與相關(guān)參考弧菌的基因組進(jìn)行比較。 Pro 使您能夠使用行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的史密斯算法靈活地執(zhí)行局部、全局和半全局成對序列比對dnastar序列比對,所有這些都在您用于多序列比對和比對后分析的同一個(gè)應(yīng)用程序中進(jìn)行。 這使得通過多重比對進(jìn)一步探索序列對的相關(guān)性、將轉(zhuǎn)錄物與基因比對或在基因組中查找基因變得容易。
成對序列比對的 4 個(gè)步驟
PCR定點(diǎn)突變
在設(shè)計(jì)質(zhì)粒之前了解突變的結(jié)構(gòu)影響
PCR定點(diǎn)誘變是將突變引入DNA序列的最常見技術(shù)之一,但大多數(shù)軟件工具在設(shè)計(jì)質(zhì)粒時(shí)并未考慮突變對蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的影響。 為 PCR 定點(diǎn)誘變的質(zhì)粒設(shè)計(jì)提供了一種獨(dú)特的方法,首先關(guān)注預(yù)測 DNA 序列中引入的哪些突變可能會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)穩(wěn)定性發(fā)生變化。 使用我們的熱點(diǎn)掃描和創(chuàng)建變體工具,您可以快速查看哪些突變減少或增加了倍數(shù)穩(wěn)定性。 一旦您確定了實(shí)驗(yàn)的最佳候選變體,您就可以創(chuàng)建 PCR 質(zhì)粒,使用我們用于設(shè)計(jì)和突變質(zhì)粒的點(diǎn)擊工具將它們引入您的序列中。 與突變實(shí)驗(yàn)的傳統(tǒng)試錯(cuò)方法相比,我們獨(dú)特的連接建模和質(zhì)粒設(shè)計(jì)工具組合可以為您節(jié)省時(shí)間和金錢。
PCR定點(diǎn)突變4步
PCR質(zhì)粒設(shè)計(jì)
使用 Pro 設(shè)計(jì)值得您第一份工作信賴的 PCR 質(zhì)粒
老實(shí)說,沒有什么比花費(fèi)時(shí)間和金錢構(gòu)建多次失敗的 PCR 反應(yīng)更令人沮喪的了。 雖然影響 PCR 成功的因素有很多,但通常當(dāng)發(fā)生失敗時(shí),不良的 PCR 質(zhì)粒設(shè)計(jì)是罪魁禍?zhǔn)住? Pro 通過設(shè)計(jì) PCR 質(zhì)粒來匹配您獨(dú)特的實(shí)驗(yàn)條件,從而解決了這個(gè)問題,讓您在實(shí)驗(yàn)室嘗試之前能夠聽到潛在變化的影響。 Pro 實(shí)現(xiàn)了可指導(dǎo)、可編輯和可定制的完美平衡,使您還可以設(shè)計(jì)出第一次就可以信賴的 PCR 質(zhì)粒。
只需 4 個(gè)步驟即可快速創(chuàng)建 PCR 質(zhì)粒設(shè)計(jì)
系統(tǒng)發(fā)育分析
準(zhǔn)確、全面的系統(tǒng)發(fā)育分析軟件
系統(tǒng)發(fā)育解剖是分子生物學(xué)的一個(gè)基本方面,也是我們理解基因、生物體和種群之間進(jìn)化關(guān)系的主要工具。 Pro 提供了一個(gè)全面、易于使用的界面dnastar序列比對,用于集成多序列比對和系統(tǒng)發(fā)育分析,無需笨重的插件。 使用鄰接或最大殘差 (RAxML) 分析選項(xiàng)輕松構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,生成多個(gè)樹以進(jìn)行并排比較,生成引導(dǎo)支持值等。 在作為圖像導(dǎo)入進(jìn)行發(fā)布或協(xié)作之前,自定義系統(tǒng)發(fā)育樹的外觀。
系統(tǒng)發(fā)育分析分 4 個(gè)步驟
入門圖
使用 Pro 輕松創(chuàng)建和定制精美、注釋準(zhǔn)確的底漆圖!
無論您是要?jiǎng)?chuàng)建用于出版還是用于克隆實(shí)驗(yàn)的引物圖譜,注釋清晰的引物都是必不可少的。 許多引物作圖工具缺乏低級(jí)選項(xiàng)并且使用起來很麻煩,導(dǎo)致圖譜不可讀,通常缺乏對實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要的功能和限制位點(diǎn)。 Pro 繪圖軟件提供了一個(gè)優(yōu)雅的界面,可以輕松創(chuàng)建和注釋圖形豐富的地圖,以進(jìn)行克隆、協(xié)作和發(fā)布。 輕松可視化和自定義您的引物圖上的位點(diǎn)和特征,并使用我們廣泛的、精選的特征數(shù)據(jù)庫,通過我們的外部手動(dòng)工具準(zhǔn)確注釋您的引物。 Pro 還包括一個(gè)自定義載體目錄,為計(jì)算機(jī)克隆提供仔細(xì)注釋的引物載體圖譜。 告別笨拙的工具,使用 Pro 輕松創(chuàng)建和定制精美的底漆地圖!
入門圖 4 個(gè)步驟
桑格序列組件
對裝配精度充滿信心
組裝測序數(shù)據(jù)是 DNA 測序中最關(guān)鍵的步驟之一,因?yàn)闇?zhǔn)確性非常重要。 我們在序列組裝軟件中使用的組裝算法已被證明是市場上 ABI 測序數(shù)據(jù)最準(zhǔn)確的算法。 與競爭對手相比,我們的算法在將序列組裝成單個(gè)重疊群方面做得最好,并通過跡線質(zhì)量和形狀調(diào)用最精確的共有序列。 組裝后,Ultra 為您提供了獨(dú)特的功能,可以輕松編輯組裝數(shù)據(jù)(暴露或修剪末端、引入突變)以及剖析組裝數(shù)據(jù),包括查看色譜圖、評(píng)估覆蓋率和分析變體。 正確地做事很重要。 使用 Ultra 中的序列組裝工具對組裝的準(zhǔn)確性充滿信心。
桑格序列組件 4 個(gè)步驟
序列編輯和注釋
使用 Pro 在一款易于使用的應(yīng)用程序中進(jìn)行全面的序列編輯和注釋!
序列編輯是分子生物學(xué)研究的重要組成部分,看起來任何序列編輯軟件都可以做到這一點(diǎn)。 但最終,您選擇的工具的便利性和功能性確實(shí)很重要。 除了提供序列編輯器的所有預(yù)期功能:改變核酸和肽、翻譯、反向互補(bǔ)、添加特征、識(shí)別 ORF 以及引入限制性位點(diǎn)的能力外,Pro 還提供手動(dòng)批量編輯工具,以便您可以編輯無縫創(chuàng)建和編輯序列組,讓您更快地完成序列編輯目標(biāo)。 Pro 中的實(shí)時(shí)交互式視圖使編輯和注釋序列、自定義功能以及創(chuàng)建引物圖變得毫不費(fèi)力。 我們的序列編輯軟件還與 NCBI 數(shù)據(jù)庫集成,用于訪問和搜索在線數(shù)據(jù)庫。 您使用的工具很重要。 使用 Pro 在一個(gè)易于使用的應(yīng)用程序中訪問序列編輯和注釋所需的一切。
序列編輯和注釋 4步
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