老習(xí)慣：先寫推理dnastar拼接序列，不要浪費時間

推薦Canu和MECAT

擁有獨特的單分子實時測序技術(shù)

（實時，SMRT）

|優(yōu)勢|

2016年以來，各類高分期刊陸續(xù)發(fā)表了借助技術(shù)獲得的高質(zhì)量基因組圖譜，表明該技術(shù)早已成為基因組研究的標配。

然而，它的序列隨機錯誤率很高（~15%）。 與 方法不同，純序列組裝使用 OLC 技術(shù)。

簡單來說，序列是借助于關(guān)系來拼接的，類似于你拼接數(shù)據(jù)的過程。

幾乎所有純數(shù)據(jù)拼裝軟件的OLC原理都分為以下幾個步驟：

從Reads中選擇非冗余的長序列（對應(yīng)）；

以上述序列為參考，與其他序列進行序列比對（類似于重測序過程）；

根據(jù)結(jié)果??，糾正隨機測序錯誤，生成一致序列；

檢測關(guān)系，加入共識序列

如右圖所示：

應(yīng)用：

從以上結(jié)果可以得出以下推論：

(1) 適用于各種物種

(2) /N50明顯低于NGS技術(shù)

（3）組裝軟件比較集中（、PBcR、canu、HGAP等）

各軟件測試情況（Rank越小dnastar拼接序列，組裝質(zhì)量越高）：

對于基因組1G以內(nèi)的物種，推論如下——

基因組：、Canu 和

25M~750M：Canu、MECAT、HGAP3

總成療效綜合表現(xiàn)：Canu和best

從計算資源消耗來看，MECAT和Canu有顯著優(yōu)勢：

參考文獻：doi:10.1093/bib/

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