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dnastar引物設(shè)計(jì) 科研小技巧(5)兩個(gè)網(wǎng)站,搞定所有sgRNA設(shè)計(jì)

發(fā)布時(shí)間:2023-07-02

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只有套路,沒有彎路!你好,我是小白

如果想要利用/Cas系統(tǒng)敲除基因,或者激活/抑制基因轉(zhuǎn)錄dnastar引物設(shè)計(jì),就必須涉及到sgRNA的設(shè)計(jì)。 明天,兩個(gè)sgRNA設(shè)計(jì)網(wǎng)站將處理所有序列的sgRNA設(shè)計(jì)!

說到這里,就必須要說到張峰大師了。 他自己建立的網(wǎng)站確實(shí)更新了很多功能。 然而不知為何,現(xiàn)在感覺繁瑣多了dnastar引物設(shè)計(jì),網(wǎng)站打不開。

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那你就只能另尋他法了。 因?yàn)橥ǔP枰膕gRNA要么是已知基因的質(zhì)粒設(shè)計(jì),要么是非編碼區(qū)的質(zhì)粒設(shè)計(jì)。

1.已知基因的質(zhì)粒設(shè)計(jì),推薦使用網(wǎng)站:

1、我們以小鼠Setd2為例,使用Cas9對(duì)其進(jìn)行激活表達(dá)。

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2、選擇相應(yīng)選項(xiàng)后,點(diǎn)擊,稍等片刻,點(diǎn)擊下載結(jié)果。

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3. 下載.txt 格式文件。 用 Excel 打開它。 紅框內(nèi)為Cas9系列。 基于載體引物(通常為BbsI)的限制性位點(diǎn),將序列添加核酸內(nèi)切酶的粘端,合成質(zhì)粒,固溶后即可與載體連接。

2.非編碼區(qū)的質(zhì)粒設(shè)計(jì),推薦使用網(wǎng)站:

1. 將設(shè)計(jì)質(zhì)粒的序列復(fù)制到框中。 這是一個(gè)隨機(jī)基因組的示例作為演示:

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2. 點(diǎn)擊后,等待一段時(shí)間,然后選擇排名靠前的sgRNA進(jìn)行質(zhì)粒合成。

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這兩個(gè)網(wǎng)站基本可以涵蓋所有關(guān)于sgRNA的質(zhì)粒設(shè)計(jì),無論你是已知基因還是非編碼區(qū),都可以搞定

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