晚上，同學(xué)讓我教她拼接順序，所以我給她寫了一個ppt。

所需軟件：,

1.打開軟件，我使用的版本是V6

選擇“序列”，然后選擇“序列拼接”

2、點擊“添加文件”，選擇需要拼接的序列。

3、最小重疊次數(shù)和一致性可以根據(jù)自己的需要進(jìn)行調(diào)整。 調(diào)整完畢后，只需點擊“拼接”即可。

注：如果重疊次數(shù)不符合預(yù)期，可適當(dāng)減少最小重疊次數(shù)。

4. 單擊“顯示結(jié)果”

(1)觀察序列的方向

注意：如果這四個序列的箭頭方向不同，則說明您加載的序列有正向和反向序列。 這時候你需要回去檢查并嘗試調(diào)整它們以向前序列。

(2)檢查四個序列的拼接情況

如果出現(xiàn)上述情況，可能是由于末端測序不準(zhǔn)確造成的。 這三個堿基可以直接刪除。

注：如果中間出現(xiàn)上述情況dnastar拼接序列，可以再次查看測序峰圖來確認(rèn)。

(3)檢查后，如果“ ”欄中沒有紅色堿基，則說明沒有問題。 選擇“導(dǎo)出”，然后選擇左上角的“保存”。

5. 序列可以組織成fasta格式

使用您剛剛保存的序列文件。 你會發(fā)現(xiàn)格式并不好看。

這個時候我一般都會用別的軟件來打開dnastar拼接序列，比如

將以上序列重新復(fù)制到剛剛打開的文件中

然后您可以添加有關(guān)序列的基本信息，例如樣本名稱、基因名稱、采樣日期等。

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