半夜，朋友讓我教她拼接順序，所以我給她寫了一個ppt

所需軟件：

1.打開軟件，我使用的版本是V6

選擇序列、序列拼接

2.點擊“添加文件”將拼接的序列選擇進去

3、最小重疊次數(shù)和稠度可根據(jù)自己的需要進行調(diào)整。 調(diào)整完畢后，點擊“拼接”。

注：如果重疊數(shù)與預(yù)期數(shù)不符，可適當(dāng)減少最小重疊數(shù)。

4. 單擊“顯示結(jié)果”

(1)觀察序列的方向

注意：如果這四個序列的箭頭方向不同，說明你加載的序列有正向和反向序列。 這時候你需要回頭檢查并嘗試將它們調(diào)整到前進的順序

(2)檢查四個序列的拼接情況

之前的情況可能是末端測序不準確，這三個核苷酸可以直接刪除

注：如果中間出現(xiàn)之前的情況dnastar拼接序列，可以再次查看測序峰圖來確認

(3)檢測后，如果“ ”一欄沒有黑色核苷酸，則說明沒有問題。 選擇“導(dǎo)出”，然后選擇左上角的“保存”。

5. 序列可以組織成fasta格式

使用剛剛保存的序列文件，你會發(fā)現(xiàn)這種格式不太好看

這個時候我一般都是用別的軟件打開這個，比如

將里面的序列復(fù)制到剛剛打開的文件中

之后，可以添加該序列的基本信息dnastar拼接序列，例如樣本名稱、基因名稱、采樣日期等。

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